Pu-Bakteeri, viljely 1 (aerobit ja anaerobit syvänäytteestä)

3491 Pu-BaktVi1

Indikaatio

Syvän bakteeri-infektion aiheuttajan / aiheuttajien etsintä.

Esivalmistelu

Mikrobiologian lähete, Mikrobiologian ja immunologian tutkimusten lähetelomake
www.nordlab.fi/wpcontent/uploads/2022/03/mikrobiologian_ja_immunologian_tutkimusten_lahetelomake_0.pdf

Lähetteessä tulee mainita seuraavat asiat: Kliininen diagnoosi, näytteenlaatu, näytteenottopaikka, mikrobilääkehoito (sekä ennen näytteenottoa että sen jälkeen aloitettu), mahdollinen immunosupressio ja perussairaudet, sekä lähettäjän yhteystiedot (myös puhelinnumero).

Näytteen käsittelyohjeet

Näytteeksi otetaan edustava märkänäyte, mieluiten ennen mikrobilääkityksen aloitusta. Näyte otetaan mahdollisimman aseptisesti iho- ja limakalvokontaminaatiota välttäen. Ihon läpi näytettä otettaessa, punktiokohta puhdistetaan huolellisesti 80 %:lla A12T:llä ennen näytteen ottamista. Pisto-, viilto-, leikkaus- tai muu syvä haava puhdistetaan huolellisesti steriilillä keittosuolalla ja ylimääräinen neste kuivataan steriilillä sideharsotaitoksella ennen näytteen (erite, kudospala) ottamista. Haavan pohjaa peittävä nekroottinen tai arpeutunut kudos tulee poistaa kirurgisesti ennen näytteen ottamista.

Näytteenotto-ohjeet: www.nordlab.fi/ammattilaisille/ammattilaisen-avuksi/ohjeita-ammattilaisille/naytteenotto-ohjeet/#nottoamm

Näyte otetaan ja lähetetään tutkittavaksi mikrobiologian laboratorioon tilanteesta riippuen jollakin seuraavista tavoista:

1) Märkänäyte syvästä absessista tai toimenpiteen yhteydessä esim. poskiontelosta, vatsaontelosta ym. otetaan suoraan steriiliin ruiskuun. Näyte siirretään ruiskusta aseptisesti kuljetusampulliin (esim. Portagerm tai vastaava) ja lähetetään siinä mikrobiologian laboratorioon. Mikäli näytemäärä on hyvin niukka ja näytteen saa kuljetettua Oulun tai Rovaniemen mikrobiologian laboratorioon välittömästi (< 2 h sisällä), voi näytteen toimittaa myös suoraan ruiskussa, joka on suljettu steriilillä korkilla (neula poistettava). Absessin poiston yhteydessä otetaan lisänäytteeksi pala absessin seinämää ja lähetetään se steriilissä astiassa tutkittavaksi (vrt. kohta 2). Tarvittaessa absessin seinämästä voidaan ottaa näyte myös vanutikkuun ja lähettää se bakteerinäytteen geelikuljetusputkessa tutkittavaksi (vrt. kohta 4).

2) Kudospalat yms. lähetetään steriilissä putkessa / purkissa. Kuivumisen ehkäisemiseksi putkeen lisätään muutama tippaa steriiliä keittosuolaliuosta. Näyte tulee toimittaa laboratorioon viipymättä. HUOM!! PÄIVYSTYSAIKANA OTETTU KUDOSPALA SÄILYTETÄÄN JÄÄKAAPISSA JA LÄHETETÄÄN HETI AAMULLA MIKROBIOLOGIAN LABORATORIOON.

3) Pisto, viilto, leikkaus- tai muusta syvästä haavasta näyte aspiroidaan ruiskuun ja siirretään aseptisesti kuljetusampulliin (esim. Portagerm). Mikäli näytemäärä on hyvin niukka ja näytteen saa kuljetettua Oulun tai Rovaniemen mikrobiologian laboratorioon välittömästi (< 2 h sisällä), voi näytteen toimittaa myös suoraan ruiskussa, joka on suljettu steriilillä korkilla (neula poistettava). Haavan pohjalta otettu kudospala lähetetään sellaisenaan steriilissä astiassa, johon lisätään muutama tippa steriiliä keittosuolaa. Vanutikkuun haavan pohjalta otettu sivelynäyte lähetetään bakteerinäytteen geelikuljetusputkessa.

4) Mikäli märkäeritettä on niin vähän, ettei sitä saada aspiroiduksi ruiskuun, sitä imeytetään vanutikkuun, joka lähetetään tutkittavaksi geelikuljetusputkessa.

5) Vierasesineet: Steriilissä astiassa, johon lisätään aseptisesti muutama tippa steriiliä keittosuolaa. Kanyylit / katetrit: leikkaa kärjestä steriileillä saksilla 2-3 cm pituinen pala ja laita se steriiliin putkeen, johon lisätään muutama tippa steriiliä keittosuolaa.

6) Poskiontelonäyte: Punktoitu märkä tai huuhtelunesteestä kerätyt märkäiset kohdat lähetetään viljelyyn kuljetusampullissa (ks. kohta 1) tai geelikuljetusputkessa.

7) Välikorvaerite: Välikorvaerite lähetetään kuljetusampullissa (esim. Portagerm) tai geelikuljetusputkessa. Näytteenotossa vältettävä näytteen kontaminoitumista korvakäytävän normaalimikrobistolla.

8) Syvät silmänäytteet (sarveiskalvo, etukammioneste, lasiainen): kts. erillinen näytteenotto-ohje. www.nordlab.fi/wp-content/uploads/2023/04/SILMAN-ALUEEN-MIKROBIOLOGISET-NAYTTEET.pdf

9) Dialyysineste: Näytettä suositellaan laitettavan kuljetusampullin (esim Portagerm) lisäksi aerobiseen ja anaerobiseen veriviljelypulloon. Jos näytettä ei riitä molempiin veriviljelypulloihin, laitetaan näyte aerobipulloon.

NÄYTTEIDEN SÄILYTYS JA LÄHETYS:

Näytteet toimitetaan mikrobiologian laboratorioon mahdollisimman nopeasti, mielellään saman päivän aikana. Näytteiden lyhytaikainen kuljetus huoneenlämpötilassa.

Steriilissä putkessa/purkissa toimitettavat näytteet (esim. kudospalat):
Jos näytteen toimitus laboratorioon kestää yli 2 tuntia, näyte säilytetään ja toimitetaan jääkaappilämpötilassa. Näyte on saatava tutkittavaksi näytteenoton jälkeen vuorokauden sisällä.

Huom! Päivystysaikana otettu kudospala säilytetään jääkaapissa ja lähetetään heti aamulla mikrobiologian laboratorioon.

Muut näytteet: Mikäli näytteitä ei voi lähettää näytteenottopäivänä, näytteet säilytetään jääkaappilämpötilassa seuraavaan kuljetukseen asti. Tällöin myös kuljetus jääkaappilämpötilassa.

Veriviljelypulloon otetut märkäviljelynäytteet: Jos näytettä ei saada esim. viikonlopun vuoksi nopeasti laboratorioon, tiettyjä näytteitä (nivel-, pleura-, vatsaontelo- yms. nesteet) suositellaan lähetettäväksi myös aerobiseen ja anaerobiseen veriviljelypulloon otettuna (tutkimuspyyntö näissäkin Pu-BaktVi1). Näytteenotossa noudatettava tarkkaa aseptiikkaa. Enintään 10 ml näytettä per pullo. Jos näytettä ei riitä molempiin veriviljelypulloihin, laitetaan näyte aerobipulloon. Hyvin niukka näyte kannattaa lähettää ensisijaisesti anaerobiampullissa. Veriviljelypullojen säilytys ja lähetys HUONEENLÄMMÖSSÄ.

Menetelmä

Bakteeriviljely aerobi- ja anaerobiolosuhteissa näytteenlaadun ja ottokohdan mukaan valituilla yleis- ja erikoiselatusaineilla.

Rikastusviljely

Kasvavat bakteerit tunnistetaan ja niille tehdään herkkyysmääritykset näytteenlaadusta ja kliinisestä kysymyksenasettelusta riippuen.

Tulkinta

Löydökset tulkitaan lähetteessä ilmoitettujen esitietojen, näytteenlaadun ja käytetyn menetelmän perusteella.

TULOKSET VALMIINA:
Alustavat aerobiviljelytulokset saadaan 1-2 vrk kuluttua ja alustavat anaerobiviljelytulokset 2 vrk kuluttua.
Mikrobilääkeherkkyysvastaukset saadaan 1-2 vrk:ssa mikrobilöydöksen vastaamisesta. Alustavasti negatiivisten näytteiden kasvatusta jatketaan pidempään ja lopulliset vastaukset valmistuvat 7-14 vrk:ssa.

Huomautukset

Tietyt bakteerit (Neisseria gonorrhoeae (gonokokki), Francisella tularensis, Legionella, Listeria, Mycobacterium tuberculosis ja muut mykobakteerit) vaativat erikoiskasvatusolosuhteita. Näitä bakteereita epäiltäessä tulee epäily mainita lähetteessä ja pyytää tutkimus erillisenä (esim. Gonokokkiviljely, Legionella-viljely, Tb-viljely). Sieni-infektiota epäiltäessä on pyydettävä sienitutkimukset erikseen.

Laboratoriota on etukäteen informoitava (soitto numeroon 040-6356305) mikäli epäillään tautia, joka voi aiheuttaa laboratoriotyössä tartuntoja (esim. Brucella-, Burkholderia pseudomallei (melioidoosi), Francisella tularensis (Tularemia) -infektion epäily).

Mikäli näytteestä halutaan viljelyn lisäksi värjäys, tulee se pyytää erikseen (tutkimuspyyntö: 1159 -BaktVr)

VIRHELÄHTEET: Näytteenottoon liittyvät virheet, kts. kohta näyte. Mikrobilääkehoito ennen näytteenottoa. Virheellinen säilytys. Kuljetusviive.

Tiedustelut

Asiakaspalvelu terveydenhuollon ammattilaisille:
Puhelin 030 660 6767
Sähköposti asiakaspalvelu@nordlab.fi

Asiakaspalvelu potilaille: 08 2377 8911